1. 对甲状腺激素的调节
PQQ 可能通过影响甲状腺细胞的功能来调节甲状腺激素的分泌。甲状腺激素（如 T3、T4）的合成和分泌受到下丘脑 - 垂体 - 甲状腺轴（HPT 轴）的精密调控。PQQ 能够作用于甲状腺细胞中的信号通路。
例如，它可能影响甲状腺细胞内的氧化还原状态。由于 PQQ 是一种强效抗氧化剂，它可以维持甲状腺细胞内环境的稳定性，防止氧化应激对甲状腺细胞功能的干扰。在甲状腺细胞的正常代谢过程中，氧化还原平衡对于甲状腺球蛋白的碘化等关键步骤至关重要。PQQ 通过调节氧化还原状态，间接影响甲状腺激素的合成和分泌。
此外，PQQ 可能调节促甲状腺激素（TSH）对甲状腺细胞的作用。TSH 与甲状腺细胞表面的受体结合后，会激活一系列细胞内信号通路来促进甲状腺激素的分泌。PQQ 或许可以通过调节这些信号通路的活性，使得甲状腺细胞对 TSH 的反应更加适度，从而调节甲状腺激素的分泌水平处于正常范围。
2. 对胰岛素分泌的调节
在胰腺 β 细胞中，PQQ 发挥着重要的调节作用。胰岛素是由胰腺 β 细胞分泌的，其分泌过程受到血糖水平等多种因素的调节。PQQ 可以改善胰腺 β 细胞的功能。 它可能通过促进胰腺 β 细胞的线粒体功能来调节胰岛素分泌。因为线粒体在 β 细胞的胰岛素分泌过程中起着关键作用，如提供 ATP，而 ATP 是触发胰岛素分泌的重要信号分子。PQQ 通过促进线粒体生成和提高线粒体的效率，增加 β 细胞内 ATP 的产生，从而刺激胰岛素的分泌。
同时，PQQ 的抗氧化作用也有助于保护胰腺 β 细胞免受氧化应激的损伤。高血糖环境会导致胰腺 β 细胞产生大量自由基，引起氧化应激，损伤 β 细胞的功能。PQQ 能够清除这些自由基，减轻氧化应激对 β 细胞的伤害，维持 β 细胞正常的胰岛素分泌功能。
3. 对性激素分泌的调节
在生殖系统方面，PQQ 对性激素分泌可能有一定的调节作用。以睾酮为例，在男性生殖系统中，PQQ 可以作用于睾丸间质细胞。这些细胞是睾酮合成的主要场所。
PQQ 可能通过调节细胞内的信号通路，如调节类固醇生成急性调节蛋白（StAR）的表达。StAR 蛋白在胆固醇向睾酮合成的转运过程中起着关键的启动作用。PQQ 促进 StAR 蛋白的表达，从而有助于睾酮的合成和分泌。
对于女性而言，PQQ 可能对卵巢细胞的功能产生影响。它可以调节雌激素的分泌，可能是通过影响卵泡的发育和激素合成相关的细胞内信号通路。例如，在卵泡发育过程中，PQQ 或许可以调节颗粒细胞的功能，这些细胞对于雌激素的合成和分泌有重要作用，从而间接调节雌激素的分泌。
4. 对肾上腺激素分泌的调节
肾上腺激素（如肾上腺素、皮质醇等）的分泌对于机体应对压力等情况至关重要。PQQ 可以调节肾上腺细胞的功能。肾上腺细胞在受到刺激（如应激刺激）时，会启动激素分泌的过程。
PQQ 通过调节肾上腺细胞内的氧化还原状态和信号通路，影响肾上腺激素的合成和分泌。例如，它可能调节肾上腺皮质细胞内参与皮质醇合成的酶（如 11β - 羟化酶等）的活性。在应激情况下，PQQ 能够使肾上腺激素的分泌更加合理，避免激素分泌过多或过少，维持机体的内稳态。