PQQ 参与能量代谢主要体现在多个方面，以下为您详细介绍：
作为辅酶参与氧化还原反应
在微生物中：PQQ 是多种细菌中醇脱氢酶、葡萄糖脱氢酶等的辅酶。以葡萄糖脱氢酶为例，PQQ 作为辅酶与酶蛋白结合形成全酶，在细胞内催化葡萄糖氧化为葡萄糖酸，同时 PQQ 接受葡萄糖氧化过程中脱下的电子，自身被还原为 PQQH₂。随后，PQQH₂将电子传递给电子传递链中的其他电子载体，如细胞色素等，从而使电子能够在细胞内有序传递，为细胞的能量代谢提供动力。
在哺乳动物中：PQQ 是线粒体中某些依赖于黄素腺嘌呤二核苷酸（FAD）的脱氢酶的辅酶，参与三羧酸循环（TCA 循环）等关键的能量代谢过程。例如，在α-酮戊二酸脱氢酶复合体中，PQQ 协助酶将α-酮戊二酸氧化脱羧生成琥珀酰辅酶 A，同时传递电子，保证 TCA 循环的顺利进行，进而促进能量的产生。
促进线粒体生物发生
调节相关基因表达：PQQ 能够激活过氧化物酶体增殖物激活受体γ共激活因子 - 1α（PGC-1α）等转录因子。PGC-1α 是线粒体生物合成的关键调节因子，它能与核呼吸因子 - 1（NRF-1）等结合，共同作用于线粒体 DNA（mtDNA）和核 DNA 上的相关基因启动子区域，促进编码线粒体蛋白的基因表达，例如细胞色素 c 氧化酶亚基等，这些蛋白是线粒体呼吸链的重要组成部分，有助于线粒体的组装和功能维持，从而增加细胞内线粒体的数量和功能活性，提高细胞的能量代谢能力。
影响线粒体功能和结构：PQQ 通过促进线粒体生物合成，使细胞内拥有更多功能完整的线粒体，增大线粒体的膜面积，增加呼吸链复合物的数量和活性，提高线粒体的氧化磷酸化效率，从而使细胞能够更高效地将营养物质转化为三磷酸腺苷（ATP），为细胞的各种生命活动提供能量。
优化细胞内能量代谢信号通路
激活 PI3K-Akt 通路：PQQ 能够激活磷脂酰肌醇 3 - 激酶（PI3K），PI3K 可将磷脂酰肌醇 - 4,5 - 二磷酸（PIP₂）转化为磷脂酰肌醇 - 3,4,5 - 三磷酸（PIP₃），PIP₃ 进而招募并激活蛋白激酶 B（Akt）。Akt 被激活后，可以磷酸化多种下游靶点，其中包括雷帕霉素靶蛋白（mTOR）。mTOR 是细胞内调节蛋白质合成和能量代谢的关键分子，激活后的 mTOR 可促进蛋白质合成，增加细胞对营养物质的摄取和利用，同时调节线粒体的功能和生物发生，促进细胞的能量代谢。
调节 AMPK 通路：PQQ 还可以调节 5' - 腺苷酸活化蛋白激酶（AMPK）通路。当细胞内 AMP/ATP 比值升高时，AMPK 被激活。PQQ 可通过某种机制增强 AMPK 的活性，激活的 AMPK 可以磷酸化多种代谢相关的酶和转录因子，如乙酰辅酶 A 羧化酶（ACC）等，促进脂肪酸氧化、葡萄糖摄取和线粒体生物发生等过程，从而维持细胞内的能量平衡，提高能量代谢效率。